随着时代发展和计算机网络的步，国者组织的影响也越来越大，甚至能左右总统办公室。但在此期间，零少校成为自己权利和望的囚徒，他与杰克之间产生了隔阂。为保险起见，让国者组织的偶像形象得以不朽，零少校启动了“童计划”，制造了一个成功的克隆胚胎，其卵来源于克拉克博士的助手，而代母亲是夏娃。这个胚胎后来诞生了三个克隆，分别是索利德?斯内克（solid?snake)，利奎德?斯内克（liquid?snake），索利达斯?斯内克（solidus?snake）

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大首领的后来被军收回，保存在冷库内，用于对战士基因分析和遗传化士兵方面的研究，之后被夏娃和奥赛罗特盗。在他们的帮助下获得了自由（deepthroat，即grayfox灰狐，在桑给尔被索立德?斯内克击败后一直被克拉克博士作为人实验对象），杀死了克拉克博士。在shadoriver（哈德逊河）事件之后，夏娃和奥赛罗特又秘密地把利奎德（liquid）和索利达斯（solidus）的血移植到大首领被烧毁的上，但大首领仍在“国者”心计算机jd和纳米计算机的控制下沉睡。最终，在奥罗特和夏娃以生命作赌注引诱大卫摧毁“国者”系统后，大卫在首领的墓前见到了大首领和零少校。大首领在墓地前杀死零少校，告诉了索立德关于国者的一切。最后大首领在引领者的墓碑前死于索立德上携带的死狐病毒（foxdie）。/p

celot）......西金特（sigint，darpa局长）........克拉克博士（空降护理para－medic）...90年代初，他被任命为国际特队“猎狐犬”的总计划指挥官。

1995年，大首领建立的由佣兵组成的武装要国家“世外天堂（outerheaven）”开始在国内开发一新型大规模杀伤武，此事引起了北约国家的注意，决定召集猎狐犬队对此事行理，但奉命发的灰狐在潜“世外天堂”的几天后即告失踪。为了破坏北约的后续计划，大首领特意派了猎狐犬队中的新兵大卫（solidsnake）继续执行任务，并给予他索利德?斯内克的称号，同时寄望于缺乏经验的斯内克的失败。但斯内克在当地抵抗组织的帮助下，成功摧毁metalgear，粉碎了大首领的野心。此后，大首领逃到中亚并在桑给尔重新建立了势力。1999年，在他的命令下，桑给尔绑架了基奥?尔夫博士，企图利用“欧利斯油藻”的研究成果和彼得洛维奇开发的新型metalgear控制世界。然而斯内克再次破坏了他的谋，他本人也在最后的决战中被斯内克用打火机和易燃雾烧成半死，国者将杰克于假死状态，仅以纳米计算机维持植人的状态而活。